其创立于1913年，最初由罗马的天主教会神父JochiGakuin创建。上智大学与早稻田大学、庆应义塾大学并称为“早庆上”，这三所学校的入学偏差值为日本关东地区私立大学中最高水平，属于关东地区私立大学第一集团，为“日本私立三大名门”之一,也被称为全日本的“最难关私立三校”——“早庆上智”，以区别于所谓“国立四大”（东京大学、东京工业大学、一桥大学、京都大学）。

「上智」日文中原意为“最高的智慧”——这是日本东京上智大学（Sophia University）校名的由来。上智大学的师生与国际上的组织有广泛的联系，其在欧美国家知名度较高，拥有非常多的欧美留学生和外国教师。其神学院与外国语学院最为有名。